1.考試試題不同

金融碩士：思想政治理論 英語一或英語二 數學三（統考）或396經濟類聯考綜合 金融學綜合

金融學碩士：思想政治理論 英語一 數學三（統考） 經濟學

2.培養方式不同

金融碩士：應用型碩士 學制2年 自費

金融學碩士：學術型碩士 學制一般3年 公費或自費或委培

3.課程設置不同

在課程設置上金融學碩士作為學歷教育，重點是基礎教育、素質教育和專業教育，偏重理論知識的掌握和學習

金融碩士作為職業教育，則更多偏重于實務，學習的目的是為了解決實際工作中的問題。

4.導師制度不同

按照教育部指導規劃，專業碩士采取雙導師制度，即社會導師和校內導師雙導師。

隨著碩士招生體制的改革不斷推進，專碩已經開始于學碩并駕齊驅，后者注重研究型人才培養，前者注重應用培養，各有所長；從中央財經、人大10級會計專碩的就業趨勢來看，完全不遜于學碩。金融專業本身就具有實踐性強的特點，兩年的全日職專業碩士(學碩一般三年)的培養方式更能滿足就業的需要。長期以來社會上一直存在大學教育與社會實踐脫節的批評，專業碩士的出臺有利于改善這種狀況。