轉錄組生物信息學分析「生物信息特訓班R語言部分轉錄組」 今天小豆培訓網學歷教育小編就來給大家簡單介紹一下。
2021年至今,“科研日精進課堂”已推出線上課程20 ,培訓學員1500 ,非常感謝小伙伴們的支持,90度鞠躬!暑期即將來臨,我們計劃充分利用這段時間,舉辦一次生物信息強基訓練營!
前期在授課中老師發現較多學員的生信基礎比較薄弱,學習起來吃力 ,所以這個“3 5 5”共13天的課程應運而生:基礎班3天,從最最基礎的linux操作、測序原理開始講起,讓0基礎的學員入門生物信息,收費1元!特訓班先用5天打開R語言世界大門,系統學習這門統計繪圖必備課程。最后學以致用,在老師帶領下,再用5天時間完成一個完整的轉錄組項目的分析與可視化作圖。
韶華易逝,莫負流年,七月趕緊來“科研日精進課堂”完成你的生信蛻變之旅吧!

主辦平臺
科研日精進課堂
授課形式
直播課 永久答疑 無限回放
3 5 5課程,自由組合學習
提供高性能服務器配合練習
課程安排
生物信息基礎班(07.07-07.09) 限時拼團價1元!!!第1天(07.07)第1天 Linux基礎(上)
1.Linux系統是什么?
2.怎么在個人電腦或服務器上安裝Linux系統
3.登錄服務器和上傳下載文件
4.怎么管理文件和目錄
5.環境變量是什么,應該怎么配置?
6.什么是用戶權限,怎么設定權限
7.怎么進行進程管理
8.Vim編輯器怎么用
14:00-17:00第2天(07.08)第2天 Linux基礎(下)
1.30個常用的Linux命令
3.如何安裝生物軟件?不同軟件的安裝方式(編譯好的和沒編譯的)
4.bioconda是什么?到底有什么用?
5.常用的三款生物軟件:blast、bowtie與samtools的使用
6.怎么讓程序在后臺一直運行
7.什么是虛擬環境?都有什么優點?
8.Singularity該如何使用
14:00-17:00第3天(07.09)第3天 測序原理與分析基礎
1.什么是測序?每種測序儀的原理是什么?
2.建庫到底是什么?怎樣建一個測序的文庫
3.測序到底有幾種,都能干什么?
4.測序的格式是什么,怎么看里面的信息
5.公共數據庫測序數據怎么查找,怎么下載
14:00-17:00生物信息特訓班-R語言部分(07.11-07.15)第4天(07.11)第1天 R語言基礎
1.如何搭建R語言環境
2.幾類R包的安裝方式
3.如何成功讀取自己的數據而不報錯
19:30-21:00第5天(07.12)第2天 R語言變量類型與控制結構
1.向量、矩陣、數據框、列表
2.字符型、數值型、整數型、復合型、邏輯型數據
3.如何用for循環批量處理大量數據
4.如何編寫可重復使用的繪圖腳本
19:30-21:00第6天
(07.13)
第3天 R語言統計分析與數據清洗
1.數據檢驗、相關性分析與回歸分析
2.寬數據與長數據的轉換
3.如何將數據轉變為可以繪圖的數據
19:30-
21:00
第7天
(07.14)
第4天 R語言繪圖基礎
1.R繪圖基礎與ggplot2繪圖
2.條形圖、折線圖、散點圖
3.直方圖、餅圖、箱線圖、小提琴圖
19:30-
21:00
第8天
(07.15)
第5天 R學術期刊繪圖
1.曼哈頓圖、火山圖、韋恩圖、Upset圖
2.熱圖、相關性系數圖、詞云圖、圈圖
3.按照學術期刊發表標準組圖并修改
19:30-
21:00
生物信息特訓班-轉錄組部分(07.18-07.22)第9天(07.18)第1天 轉錄組分析基礎
1.轉錄組分析中的名詞與要點
2.無參轉錄組與有參轉錄組的分析方法
3.如何評價測得的轉錄組數據
4.怎樣對轉錄組測序數據進行過濾
19:30-21:00第10天(07.19)第2天 數據比對和組裝
1.怎樣對無參轉錄組進行組裝
2.如何選擇合適的參考基因組并進行分析
3.計算基因表達量的方式
4.怎么進行差異基因分析
5.畫差異基因的熱圖、火山圖
19:30-21:00第11天
(07.20)
第3天 基因功能注釋
1.NR、Swissprot、KOG/COG、Pfam注釋
2.GO功能注釋及富集分析
3.KEGG功能注釋及富集分析
4.如何把基因熱圖展現在通路上
19:30-
21:00
第12天
(07.21)
第4天 轉錄組個性化分析
1.如何進行進行轉錄因子分析
2.轉錄組的突變位點分析
3.IGV基因組可視化
4.基因功能分析利器Mapman
19:30-
21:00
第13天
(07.22)
第5天 基因網絡分析及轉錄組文章解讀
1.蛋白互作網絡分析
2.WGCNA基因共表達網絡
3.Cytoscape網絡圖的繪制
4.如何使用轉錄組數據發表文章(純生信或濕實驗 生信)
19:30-
21:00
課程插圖

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